حضرت آیت الله خامنه ای رهبر معظم انقلاب اسلامی در پیامی درگذشت آیت الله آقای حاج سیدجعفر کریمی را تسلیت گفتند. متن پیام تسلیت رهبر معظم انقلاب به این شرح است:
بسم الله الرحمن الرحیم
درگذشت فقیه بزگوار مرحوم آیت الله آقای حاج سیدجعفر کریمی رضوان الله علیه را به خاندان محترم و همۀارادتمندان و شاگردان ایشان تسلیت عرض میکنم.
این عالم بزرگوار از جمله فضلایی بودند که در سالهای اقامت امام راحل در نجف اشرف حلقۀنزدیک علمی آن بزرگوار را تشکیل میدادند و در سالهای پس از انقلاب نیز به خدمات ارزشمند خود ادامه دادند. پس از رحلت ایشان نیزدر شمار همکاران اینجانب در قم بودند و اینجانب سالها برخوردار از خدمات ایشان بودم. از خداوند متعال رحمت و مغفرت و علو درجات و حشر با اجداد طاهرین را برای ایشان مسألت مینمایم.
سیدعلی خامنه ای